Bệnh viện Nhi Trung ương đã được Bộ trưởng Bộ Y tế phê duyệt Quy chế Tổ chức và Hoạt động mới tại Quyết định số 6568/QĐ-BYT ngày 30/10/2018, các đơn vị trực thuộc Bệnh viện Nhi Trung ương như sau:
Bệnh viện Nhi Trung ương đã được Bộ trưởng Bộ Y tế phê duyệt Quy chế Tổ chức và Hoạt động mới tại Quyết định số 6568/QĐ-BYT ngày 30/10/2018, các đơn vị trực thuộc Bệnh viện Nhi Trung ương như sau: